Un grupo de investigadores desaparece en las montañas de Turquía, donde, según la Biblia, cayó el Arca de Noé. Se llaman Spriggan y pertenecen a una organización que busca los enigmas de antiguas civilizaciones. A la vez, desaparecen tres satélites militares estadounidenses. Meses más tarde, en Japón, un Spriggan recibe un mensaje-bomba anónimo. Va a empezar una guerra que determinará la supervivencia de la humanidad.

La guerra estalla en Oriente Media cuando las Armaduras Tácticas son introducidas en el ejército por 2 fuerzas opuestas. Yushiro es el hijo menor de la poderosa familia Gowa de Japón, y es enviado a la guerra como piloto de una de estas máquinas. En las fuerzas enemigas se encuentra con Miharu, otra piloto de Armadura Táctica como él. Pero ¿dónde lo ha visto antes? ¿Qué conexión tiene con su pasado? ¿Por qué Miharu no quiere que se una a Gasaraki? A medida que el destino complica sus respectivas misiones, deberán buscar juntos las respuestas ocultas en el fondo de su mente.

Noir desde la noche de los tiempos, ese nombre evoca el proceder del destino. Las doncellas de manos negras que reinan sobre la muerte y protegen la paz de los inocentes. Bajo el apodo de Noir, la atractiva Mireille Bouquet es una de las asesinas profesionales más respetadas del mundo. Tras recibir en su base de operaciones de París un misterioso e-mail procedente de Japón decide viajar al país del sol naciente para investigar.