Ayudado por su amigo Doc, Marty McFly viaja de nuevo en la máquina del tiempo para ayudar a su hijo en el futuro. Pero las cosas se complicarán esta vez, ya que el malvado Biff del año 2015 se hace con un manual deportivo que recoge los resultados de todas las competiciones entre 1950 y 2000, entregándoselo a su otro yo del año 1955. Cuando Marty regresa a su línea temporal habitual, en 1985, las cosas han cambiado bastante.

Ante la amenaza de destrucción del planeta Krypton, Jor-El introduce a su hijito en una nave que lo conduce hasta la Tierra. Adoptado por la familia Kent, el bebé crece bajo el nombre de Clark, dando muestra de una fuerza extraordinaria. Años más tarde empieza a trabajar como periodista ocultando su verdadera identidad de Superman.

Un viejo bucanero vive escondido en la posada de Ben Bow. El filibustero guarda en un baúl un valioso plano que indica el lugar exacto donde se oculta el tesoro de las innumerables andanzas del pirata Flint. El malhechor muere y la localización del botín, que buscan muchos aventureros, va a parar a manos del pequeño Jim Hawkins, hijo del dueño del hospedaje.

La vida de Joan Wilder, famosa novelista neoyorquina, está a punto de convertirse en una aventura apasionante. Su hermana Elaine ha sido secuestrada en Colombia y sólo será liberada si Joan entrega a los secuestradores el mapa de un tesoro que ella, sin saberlo, posee. Joan tendrá que superar todo tipo de obstáculos y peligros como si de una de sus novelas se tratara... En medio de este caos, aparece Jack Colton, un mercenario que sólo trabajaba por dinero, pero que se convierte en el valiente héroe con el que Joan siempre había soñado.

Larry Daley, un soñador que no tiene donde caerse muerto y cuyas imaginativas ideas nunca le han reportado nada, se halla acuciantemente necesitado de conseguir un empleo. Larry siempre ha creído estar destinado para grandes cosas. Pero no tiene idea de cuán literalmente ciclópeo y peliagudo es el reto al que tendrá que enfrentarse cuando acepta, a regañadientes, el supuestamente humilde turno de madrugada como guarda de seguridad en el Museo de Historia Natural. En su primera noche de trabajo, Larry recibe una linterna descomunal y un folleto de instrucciones con las hojas señaladas; a continuación, se queda solo en el silencio espectral de un museo que más parece una caverna. Al menos, piensa que está solo.