Bourne es un hombre sin país y sin pasado. Después de ser sometido a un brutal entrenamiento del que no recuerda nada por personas a las que no consigue identificar, se convirtió en una sofisticada arma humana, y ahora se ha convertido en el objetivo más escurridizo de la CIA. Desde que le encontraron flotando en el mar Mediterráneo italiano hace varios años, inició una búsqueda desesperada para saber quién es y quién le enseñó a matar.

Después de destruir accidentalmente uno de sus propios tanques, el teniente coronel Nathan Serling vuelve a casa. La armada oculta el incidente y asigna a Serling la misión de investigar a un piloto de helicóptero que está a punto de convertirse en la primera mujer en recibir la medalla de honor. Pero testimonios falsos obstaculizan la búsqueda de la verdad cuando Serling intenta descubrir los misterios que rodean su muerte.