Enmarcado en un futuro próximo, eXistenZ describe una sociedad en la que los diseñadores de juegos son venerados como superestrellas y donde los jugadores pueden entrar orgánicamente en estos juegos. Allegra Geller es la autora del juego más novedoso, una creación donde los usuarios no distinguen entre la realidad y la fantasía.

Pierre Brossard, perteneciente al régimen Vichy, mató a unos judíos en tiempos de guerra. Consiguió, durante los tiempos de paz, el indulto y ha estado escondido y protegido durante todos estos años por la Iglesia Católica. Ahora, un asesino a sueldo intenta matarlo. Brossard consigue ir escapando recurriendo a todos sus contactos.