El Raisuni, jefe de los bereberes, ha secuestrado a la estadounidense Eden Pedecaris y a sus hijos, que se encuentran en Tánger, para pedir una fuerte recompensa. La mujer intenta escapar, pero antes intervienen los marines estadounidenses. Finalmente se llega a un acuerdo con Raisuni y le envían un rescate de oro que transportan fuerzas alemanas. Sin embargo, las tropas germanas no cumplen el acuerdo y le capturan.

John Blackthorne, un navegante inglés que naufraga en la costa de Japón. Al ser rescatado se convierte en testigo de la peligrosa lucha de Toramaga, un señor feudal que pretende ser Shogun, el máximo dictador militar. Paralelamente Blackthorne va a encontrarse irresistiblemente atraído por la confusión y decide ser el primer "Gai-Jin" (extranjero) que se convierta en un guerrero samurai.